Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf89P0DMQ9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms