Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms