Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRCP08575 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRCP08575 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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