Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJB1P08034 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms