Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNW1P05000 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms