Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNB1P01574 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms