Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA10O75578 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms