Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF253O75346 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF253O75346 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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