Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms