Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRS3O43559 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FRS3O43559 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms