Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OIP5O43482 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OIP5O43482 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms