Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXC11O43248 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC11O43248 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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