Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms