Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCER2I3L3R5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCER2I3L3R5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms