Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms