Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C5orf58C9J3I9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms