Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSTM2BA6NLU5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms