Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms