Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GMNCA6NCL1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms