Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms