Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPED1A4D0V7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms