Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FRMD3A2A2Y4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms