Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms