Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIF3AQ9Y2N7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIF3AQ9Y2N7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms