Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHOC2Q9UQ13 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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