Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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