Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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