Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms