Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO3Q9UK99 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms