Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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