Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms