Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCF2Q9UG63 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCF2Q9UG63 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms