Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL42Q9P2K6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms