Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDL2Q9NX52 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms