Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms