Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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