Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms