Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms