Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms