Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMG20AQ9NP66 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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