Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPJQ9HC77 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPJQ9HC77 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms