Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms