Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTN4Q9HB63 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTN4Q9HB63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms