Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms