Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2J2Q9GZM3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms