Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4CQ9C0C4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms