Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXQ1Q9C009 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1Q9C009 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms