Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BCO2Q9BYV7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms