Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms