Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPERQ9BY12 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms